Normalmente la reazione allo stress coinvolge sia i parametri comportamentali che fisiologici. Le reazioni più comunemente osservabili allo stress sono azioni come il mordere o il calciare, ma le conseguenze di uno stato di stress molto forte possono arrivare a interessare le capacità riproduttive, quelle sportive, o coinvolgere più genericamente lo stato di salute del cavallo. Ci sono dei comportamenti che ci indicano chiaramente come il cavallo sia sotto stress (anche se blando), e sono il leccare le cose vicine a lui, o morderle. O, ancora, ondeggiare continuamente.

Gli studi intorno al trasporto cavalli, hanno preso maggiormente in considerazione le conseguenze fisiologiche dello stress piuttosto che quelle comportamentali. Indicatori sicuri dello stato di stress sono l'andamento della frequenza cardiaca e respiratoria, la sudorazione eccessiva, il livello di secrezioni ormonali e i livelli ondeggianti di leucociti nel sangue.
Lo stress viene definito cronico quando dura uno-due giorni e causa cambiamenti nel sistema immunitario, nella capacità di digerire bene, e nell'apparato riproduttivo. Tutto ciò può durare anche parecchio tempo dopo la fine dell'evento stressante. A volte purtroppo capita che il trasporto cavalli su trailer o su van sia causa di morte del cavallo trasportato, o per colpa di un incidente o per colpa di quella che viene comunemente chiamata febbre da trasporto (polmonite), conseguenza ultima dello stress cronico.

Nel trasporto cavalli è imperativo controllare lo stress dei cavalli. Per prima cosa occorre individuarne subito i segnali nel comportamento del cavallo.
Un trasporto causa inevitabilmente effetti negativi, però noi possiamo renderli minimi attraverso una serie di accorgimenti: dare a ogni cavallo lo spazio idoneo sia in superficie che in cubatura, fare attenzione alla formazione dei gas che si formano dalla lettiera, l'igiene generale del mezzo di trasporto, la medicina preventiva, la nutrizione e l'abbeveramento durante il trasporto, la condizione fisica generale dell'animale prima di partire, porre attenzione nell'evitare che il cavallo si ferisca salendo e scendendo dal trailer o dal van, l'utilizzo di mezzi idonei al servizio che devono svolgere e il numero di cavalli caricati nello stesso mezzo.