Una causa molto comune di stress e' il posizionamento dei cavalli durante il trasporto. Da tutte le prove che sono state fatte, e' risultato che la migliore posizione in cui mettere i cavalli sia sui trailer che sui van e' quella contraria al senso di marcia. Questa e' la posizione che permette al cavallo di avere il minor aumento di frequenza cardiaca e respiratoria. Sofisticati esami del sangue hanno fornito parecchie altre ragioni per preferire questa posizione a quella piu' intuitiva che al contrario comporta una posizione favorevole al senso di marcia.

La ragione per cui conviene effettuare il trasporto cavalli con questo posizionamento e' che in questo modo le zampe posteriori saranno piu' vicine alla forza motrice e quindi sopporteranno con minore sforzo le sollecitazioni causate da accelerazioni e frenate di quanto non avrebbero fatto le zampe anteriori; al contempo, le zampe anteriori saranno relativamente piu' lontane dalla forza motrice, e saranno quindi piu' capaci di rispondere a sollecitazioni di tipo laterale a seguito di curve e cambi di direzione di quanto non avrebbero fatto le zampe posteriori.
Se nel trasporto cavalli il posizionamento e' quello che abbiamo descritto sopra, i grandi muscoli del posteriore potranno rispondere piu' facilmente alle sollecitazioni antero-posteriori caratteristiche di un viaggio motorizzato, e nel caso di una accelerazione o una frenata piu' brusca del normale i piccoli passettini che il cavallo farà non lo metteranno in eccessiva ansia e difficoltà.

In particolare se il cavallo è posizionato nel senso di marcia, in caso di frenate ripetute succederà che l'animale avrà la sensazione di essere legato e reagirà come di solito fa ogni cavallo in una situazione del genere: allargherà le zampe anteriori, sposterà la testa in avanti e metterà le zampe posteriori sotto di sé ... con evidenti e intuitive conseguenze sulla stabilità del trailer e del mezzo trainante. Tutto questo non succede se il cavallo viene posizionato in senso contrario a quello di marcia. In questo caso (quello di posizionamento contrario al senso di marcia) la sollecitazione causata da una accelerazione è piu' facile da gestire per il cavallo perchè sia la testa che le zampe anteriori godono di una relativa maggiore libertà di movimento (soprattutto se si usa un van).

Un fattore che può rendere il trasporto cavalli una routine o una tragedia e' la capacità del conducente di effettuare il trasporto stesso, la buona salute dei cavalli, e il numero di cavalli coinvolti nel trasporto (per fare un solo esempio considerate che il panico è contagiosissimo).